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尊龙凯时无培育型靶向NGS方案:全面覆盖结核亚型及耐药基因

发布时间:2025-02-27   信息来源:尊龙凯时官方编辑

结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)是一种全球性的重要致病菌,其引发的结核病被视为一种高致死率的疾病。标准株H37Rv的基因组于1998年完成测序,基因组大小约为44Mb,包含超过3,900个蛋白编码基因。结核分枝杆菌可分为七个主要谱系,目前已知的耐药基因包括embB、rpoB和gyrA等。

尊龙凯时无培育型靶向NGS方案:全面覆盖结核亚型及耐药基因

在2023年10月17日,世界卫生组织(WHO)官网发布了《应用新一代测序检测技术开展耐药结核病监测的实施性手册》。WHO指出,新一代测序(NGS)技术可以提供全面的耐药谱系检测,减少对表型药敏检测的需求,特别对于那些表型药敏检测不可靠的药物尤为重要。NGS技术有望为结核病的治疗方案制定提供更为全面的耐药谱检测,从而提高化疗方案制定的精准性。

由于结核杆菌的基因组较大,目前常用的靶向结核NGS方法(tNGS)大多无法全面覆盖所有亚型及耐药基因。尽管全基因组测序(WGS)能够实现覆盖,但需要培养物以确保检测的可靠性。为此,尊龙凯时推出了QIAseq x HYB Mycobacterium Tuberculosis Panel,该试剂盒无需培养即可直接实现结核的全基因组靶向建库,并覆盖七种主要谱系亚型及所有已知耐药基因。

QIAseq x HYB Mycobacterium Tuberculosis Panel基于杂交捕获技术,支持痰液、脑脊液及粪便等样本的TB全基因组测序,所需起始DNA仅为10ng,无需提前培养。该技术的高特异性和灵敏度捕获探针即使在低拷贝样本中也能实现基因组的高覆盖,难以覆盖的PE/PPE基因区域也能达到均匀的高深度覆盖,从而实现结核病的明确分型。

获得TB的全基因组数据后,可以使用CLC Genomics Workbench的结核分枝杆菌分析工具和流程,一键式完成质量控制、序列比对、谱系鉴定及耐药变异等分析。此外,还可以进行变异注释和比较、变异对蛋白结构的影响分析、cgMLST分型、最小生成树构建和SNP tree分析。

除了QIAseq x HYB Mycobacterium Tuberculosis Panel,尊龙凯时还推出了QIAseq x HYB HepC Panel,用于丙型肝炎病毒的全基因靶向测序,同样覆盖所有丙肝病毒亚型,并无缝对接CLC Genomic Workbench生物信息分析系统,实现了一键获得分析结果的便捷体验。未来,QIAseq x HYB将推出针对客户目标微生物的定制化靶向Panel,敬请期待!如需了解更多信息,请联系尊龙凯时获取更多支持。